Une équipe scientifique de trois centres espagnols a été séquencé pour la première fois le génome entier de l’olivier. Le spécimen a plus de 1300 ans et est la variété Farga, l’un des plus importants dans l’est de l’Espagne. Les résultats sont publiés aujourd’hui dans le journal d’accès libre GigaScience et peuvent contribuer à l’amélioration génétique de la production d’olives et d’huile d’olive, de grande importance dans l’économie et dans le régime espagnol, disent les auteurs.
L’olivier est l’un des premiers arbres qui ont été domestiqués dans l’histoire de l’humanité, probablement il ya environ 6.000 ans. Symbole par excellence de la Méditerranée, a une grande importance dans l’économie espagnole et dans des pays comme l’Italie, la Grèce et le Portugal). Il n’est pas surprenant que l’Espagne soit le plus grand producteur d’huile d’olive au monde. Chaque année, près de trois millions de tonnes d’huile sont produites à la fois pour la consommation locale et pour l’exportation, dont l’Espagne en produit un tiers.
Les résultats pourraient contribuer à l’amélioration génétique de la production d’olives et d’huile d’olive
Cependant, jusqu’à présent, le génome de l’olive qui régule, par exemple, les différences entre les variétés, les tailles et la saveur des olives, pourquoi vivent-ils si longtemps, ou les clés de leur adaptation à la terre sèche était inconnue.
Une équipe de chercheurs du Centre de Régulation Génomique (CGR) de Barcelone, du Jardin Botanique Royal de Madrid-CSIC et du Centre National d’Analyse Génomique de Barcelone (CNAG-CRG) a mis en lumière le puzzle génétique de l’olivier Atteindre la première séquence au génome complet de cette espèce.
Financement privé
Les résultats de ce travail, entièrement financé par le Banco Santander, ont été collectés le 29 juin 2016. L’étude ouvre la porte à de nouvelles recherches qui aideront à l’olivier, à la fois son développement et de se protéger contre les infections qui sont Causant maintenant des ravages, de telles attaques de bactéries (Xilella fastidiosa) et de champignons (Verticillium dhailae).
Le travail, coordonné par Pablo Vargas, chercheur de la SCCI au Royal Botanic Garden, a duré trois ans. « Dans le séquençage d’un génome il ya trois phases: la première, d’isoler tous les gènes, ce qui est quelque chose que nous avons publié il ya deux ans.Le second, assembler le génome, c’est-à-ordonner ces gènes un après l’autre, comme si concatenaramos phrases en vrac À partir d’un livre et, enfin, d’identifier tous les gènes, qui sont le montage du livre.Ces deux dernières phases sont présentes et nous l’avons fait maintenant », a déclaré Vargas.
Selon le CNAG-CRG de Tyler Alioto, «ce génome a généré 1,31 milliards de lettres, soit plus de 1 000 GB de données. Nous sommes surpris parce que nous avons détecté environ 56 000 gènes, nettement plus élevés que ceux détectés dans des génomes séquencés de plantes apparentées et en double Le génome humain. »
Les auteurs ont identifié environ 56 000 gènes, deux fois le génome humain
L’évolution des oliviers de différents pays leur a également permis de découvrir ses origines et de dévoiler les clés qui lui ont permis de s’adapter à des conditions environnementales très différentes; Aussi, obtenir les clés de leur longévité extraordinaire, car ils peuvent vivre jusqu’à 3000 et 4000 ans.